北京市农林科学院蔬菜研究所成立于1958年，1995年被认定为“国家蔬菜工程技术研究中心”，2022年成功组建“蔬菜生物育种全国重点实验室(北京)”，拥有8个专业研究室，10个省部级科研平台和1个ISTA国际认证的种子检测实验室。培养国家农业产业技术体系首席专家、国家级突出贡献专家、万人计划、百千万人才、优青等国家级人才10人，各类省部级人才30余人次。建立了以种质创新为核心，以安全生产为支撑的蔬菜“全产业链”科技创新体系。“十二五”以来，主持获得国家科技进步奖2项、省部级科技奖励20余项；培育优质多抗蔬菜新品种329个，其中获得植物新品种保护权52个；授权国家发明专利200余项；发表论文600余篇，SCI收录296篇。

1982年建成国内第一座蔬菜种质资源中期库，收集、保存蔬菜种质资源3.5万份。在国际上率先构建了西瓜、南瓜、白菜、花椰菜等蔬菜作物全基因组图谱与变异组图谱；首创了芸薹属游离小孢子、瓜类大孢子、茄果类花药培养规模化单倍体诱导技术流程；建成了我国首个蔬菜高通量分子育种技术平台；牵头研制蔬菜种子质量检测行业标准；引领蔬菜工厂化育苗、无土栽培和优质安全生产设施技术革新；蔬菜新品种年推广面积达2000万亩，直接经济效益连续3年超2亿元。